饮用水消毒的目的是杀灭水中对人体健康有害的绝大部分病原微生物，其中包括细菌、病毒、原生动物等，以防止通过饮用水传染疾病。由于消毒处理并不能完全杀灭水中所有微生物，所以消毒处理是在达到饮用水水质微生物学标准的条件下，将饮用水导致的水介传染病的风险降到最低，达到完全可以接受的水平。因此自来水在生产过程中必须加氯消毒，保证饮水安全，防止水媒传染病发生，且国家标准中强制要求管网水中必须有一定量的余氯存在，以防止管网二次污染。自来水中有氯味是正常的，说明饮用水是安全的，人们应当习惯这个味道。若没有氯味，反倒是不正常的。
